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 Por su ubicación estratégica Villa de Merlo fue calificada como la Capital del Tercer Microclima del Mundo, con veranos cálidos e inviernos abrigados por el calorcito del sol bajo azules cielos despejados. Además las Sierras de los Comechingones protege la Villa de las corrientes de aire húmedo provenientes del Atlántico y de los elementos contaminantes que arrastran a su paso por la pampa húmeda y actúa como filtro natural que deja el aire libre de contaminación. El clima es relativamente seco con temperatura media anual de 20 C°. En verano los registros oscilan entre los 18 y 33 C°, mientras que en el invierno oscila entre 4 y 17 C°. Conocida por su excelente microclima se explica que esto se debe a que posee una atmósfera cuyas proporciones de ozono resultan más elevadas que las normales, y en la cual hace su manifestación excepcional la radiactividad; generadora de óxido nitroso, el cual por vía de la inhalación produce sensación de bienestar; caracterizada por ser una de las pocas regiones del mundo en contar con altos porcentajes de ionización negativa, condición natural que produce efectos energizantes y estimulantes influenciando positivamente el ánimo humano.